Folding, Design, and Determination of Interaction Potentials Using Off-Lattice Dynamics of Model Heteropolymers
نویسندگان
چکیده
منابع مشابه
Folding, Design and Determination of Interaction Potentials Using Off-Lattice Dynamics of Model Heteropolymers
We present the results of a self-consistent, unified molecular dynamics study of simple model heteropolymers in the continuum with emphasis on folding, sequence design and the determination of the interaction parameters of the effective potential between the amino acids from the knowledge of the native states of the designed sequences. PACS numbers: 87.15.By, 87.10.+e
متن کاملFreezing and folding behavior in simple off-lattice heteropolymers.
We have performed parallel tempering Monte Carlo simulations using a simple continuum heteropolymer model for proteins. All 10 heteropolymer sequences which we have studied have shown first-order transitions at low temperature to ordered states dominated by single chain conformations. These results are in contrast with the theoretical predictions of the random energy model for heteropolymers, f...
متن کاملthe innovation of a statistical model to estimate dependable rainfall (dr) and develop it for determination and classification of drought and wet years of iran
آب حاصل از بارش منبع تأمین نیازهای بی شمار جانداران به ویژه انسان است و هرگونه کاهش در کم و کیف آن مستقیماً حیات موجودات زنده را تحت تأثیر منفی قرار می دهد. نوسان سال به سال بارش از ویژگی های اساسی و بسیار مهم بارش های سالانه ایران محسوب می شود که آثار زیان بار آن در تمام عرصه های اقتصادی، اجتماعی و حتی سیاسی- امنیتی به نحوی منعکس می شود. چون میزان آب ناشی از بارش یکی از مولفه های اصلی برنامه ...
15 صفحه اولLattice model for rapidly folding protein-like heteropolymers.
Protein folding is a relatively fast process considering the astronomical number of conformations in which a protein could find itself. Within the framework of a lattice model, we show that one can design rapidly folding sequences by assigning the strongest attractive couplings to the contacts present in a target native state. Our protein design can be extended to situations with both attractiv...
متن کاملcomparative dna interaction studies of antiviral drug, zidovudine and its complex using different instrumental methods
هدف از این مطالعه بررسی امکان استفاده از داروهای شناخته شده در درمان سایر بیماریها به عنوان داروهای ضد سرطان است. همچنین با استفاده از این داروها در ساختمان کمپلکس فلز می توان شاخص های دارویی بدست آمده را بررسی نمود. داروی ضد ویروس ایدز(hiv)به نام زیدوودین(azt)انتخاب و.کمپلکس.محلول.در.آب[pt(azt)2]cl2سنتزو به روشهای مختلف فیزیکی و شیمیایی شناسایی گردید. بر هم کنش مقایسه ای این دارو و کمپلکس پلا...
15 صفحه اولذخیره در منابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ژورنال
عنوان ژورنال: Physical Review Letters
سال: 1998
ISSN: 0031-9007,1079-7114
DOI: 10.1103/physrevlett.81.3287